More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1215 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.4 
 
 		 675 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 675 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.55 
 
 		 675 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 675 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 675 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  61.15 
 
 		 675 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 678 aa  1358    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.59 
 
 		 677 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 		 674 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  31.35 
 
 		 672 aa  236  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 673 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 673 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 		 673 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 		 674 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.22 
 
 		 673 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.22 
 
 		 673 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 		 675 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 675 aa  205  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 		 673 aa  200  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 673 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 		 673 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 673 aa  197  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  37.87 
 
 		 666 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 673 aa  194  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  37.16 
 
 		 674 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  29.57 
 
 		 673 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  27.1 
 
 		 663 aa  187  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  29.12 
 
 		 672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  33.8 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 658 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 623 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 564 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 533 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 541 aa  173  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.16 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 544 aa  172  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.76 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 638 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.76 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 541 aa  171  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  35.36 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  32.56 
 
 		 543 aa  170  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  27.79 
 
 		 672 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.11 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 		 676 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 631 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 		 640 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 661 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 640 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.54 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  36.64 
 
 		 561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 543 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.86 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  32.41 
 
 		 626 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  34.03 
 
 		 629 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  34.48 
 
 		 623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 		 716 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  34.02 
 
 		 628 aa  165  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 547 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  35.43 
 
 		 639 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 620 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.61 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  30.59 
 
 		 636 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 573 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  32.37 
 
 		 652 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 642 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 		 639 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.07 
 
 		 623 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  31.78 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 572 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  34.32 
 
 		 543 aa  161  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 544 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 700 aa  161  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 557 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>