More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1313 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 677 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84 
 
 		 675 aa  1113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84 
 
 		 675 aa  1104    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.3 
 
 		 675 aa  1113    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.15 
 
 		 675 aa  1113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  56.15 
 
 		 675 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 675 aa  1353    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 678 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 674 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  30.39 
 
 		 674 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 		 674 aa  227  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 		 675 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 673 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  29.99 
 
 		 672 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 673 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.65 
 
 		 673 aa  221  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 		 673 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 673 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26 
 
 		 673 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 673 aa  210  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 673 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 673 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  27.2 
 
 		 672 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  29.12 
 
 		 673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 		 675 aa  194  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.11 
 
 		 673 aa  194  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  35.77 
 
 		 674 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 		 673 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  35.79 
 
 		 663 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  35.65 
 
 		 672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.29 
 
 		 712 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  34.72 
 
 		 666 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 541 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.32 
 
 		 712 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 		 541 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 716 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 676 aa  173  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 541 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 541 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  32.86 
 
 		 544 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  33.61 
 
 		 541 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  36.55 
 
 		 663 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  32.75 
 
 		 568 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  36.67 
 
 		 639 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  34.09 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 626 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 539 aa  165  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  35.96 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 632 aa  164  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 541 aa  164  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  33.05 
 
 		 626 aa  164  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 547 aa  164  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 541 aa  163  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 655 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  30.35 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.83 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  36.66 
 
 		 628 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.38 
 
 		 623 aa  161  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 		 541 aa  161  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 623 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 545 aa  160  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 671 aa  160  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.86 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2526  methyl-accepting chemotaxis protein  32.17 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.07 
 
 		 623 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 555 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  31.13 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 623 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  31.56 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34 
 
 		 559 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 647 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.79 
 
 		 666 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  31.12 
 
 		 493 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 623 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 628 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  33.91 
 
 		 701 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 623 aa  158  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2059  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 491 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116428  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 681 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 639 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 554 aa  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 		 544 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>