More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1402 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.11 
 
 		 675 aa  1340    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.3 
 
 		 675 aa  1112    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.56 
 
 		 675 aa  1346    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 		 675 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.14 
 
 		 677 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.7 
 
 		 675 aa  1347    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 678 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 675 aa  1350    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 		 674 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.38 
 
 		 674 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 		 674 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.25 
 
 		 673 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 675 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.35 
 
 		 673 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.35 
 
 		 673 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 		 673 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  27.02 
 
 		 673 aa  210  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 		 673 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 		 672 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 		 673 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 673 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 673 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 		 673 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  28.48 
 
 		 673 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 		 675 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 673 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  35.01 
 
 		 666 aa  187  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  26.94 
 
 		 672 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  34.73 
 
 		 674 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 663 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  36.52 
 
 		 639 aa  180  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.61 
 
 		 712 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 658 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 676 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  33.05 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 541 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 713 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  32.3 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 655 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 541 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 547 aa  171  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 716 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  32.38 
 
 		 541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 642 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 640 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 681 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 632 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.39 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  29.46 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 		 568 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 543 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 631 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  33.52 
 
 		 642 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  24.79 
 
 		 661 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  34.51 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 639 aa  163  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 572 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 		 623 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 701 aa  161  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  32.95 
 
 		 553 aa  161  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 411 aa  161  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  30.47 
 
 		 546 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 535 aa  161  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  30.77 
 
 		 538 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 554 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  33.25 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 392 aa  160  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2059  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 491 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116428  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.01 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 554 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  29.61 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.24 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  33.81 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  37.24 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>