More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01085 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
672 aa  1335    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  31.97 
 
 
672 aa  274  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 
673 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 
673 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
674 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.59 
 
 
674 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.09 
 
 
673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 
674 aa  244  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
673 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.96 
 
 
673 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 
673 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.11 
 
 
673 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 
673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.31 
 
 
675 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
673 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
673 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 
677 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 
673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 
673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.11 
 
 
675 aa  233  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  29.16 
 
 
673 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
675 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 
675 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
675 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
675 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 
675 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 
675 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
564 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
678 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 
639 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
636 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 
638 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
544 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
499 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
679 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
541 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
541 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  34.64 
 
 
541 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
572 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 
543 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 
638 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  28.89 
 
 
666 aa  170  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
650 aa  170  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 
642 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 
642 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  34.59 
 
 
638 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
541 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
663 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
638 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  31.35 
 
 
628 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  29.71 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
658 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 
707 aa  167  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  34.67 
 
 
638 aa  167  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 
541 aa  167  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 
638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 
772 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 
681 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 
573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 
645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 
543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 
541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  35.24 
 
 
676 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 
541 aa  164  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
645 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
541 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 
646 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 
638 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 
638 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 
636 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.56 
 
 
650 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 
638 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 
544 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  34.94 
 
 
642 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  34.16 
 
 
674 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
645 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
645 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  34.73 
 
 
541 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  34.33 
 
 
539 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 
541 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100073  normal  0.0339889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
405 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  32.86 
 
 
545 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 
544 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 
643 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  31.53 
 
 
632 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 
620 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  33.84 
 
 
519 aa  160  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  32.93 
 
 
628 aa  160  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  36.09 
 
 
646 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  33.63 
 
 
545 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  33.42 
 
 
672 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  30.77 
 
 
629 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 
637 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 
569 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  34.73 
 
 
541 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>