150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1238 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1238  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2486  LuxR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3181  sigma-70, region 4 type 2  43.16 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0394  regulatory protein, LuxR  55.77 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0417194  normal  0.0540308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2898  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  44.62 
 
 		 919 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 226 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 74 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 514 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 514 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 514 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 202 aa  47.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 74 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 510 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 320 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  50 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 510 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 510 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4704  DNA-binding response regulator CorR  45 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0626  germination protein GerE  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4609  germination protein GerE  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4629  germination protein GerE  50 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2565  response regulator protein  41.94 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140338  decreased coverage  0.00000000000000164026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 1336 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 227 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 240 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 305 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 361 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1307  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 131 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 309 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  44 
 
 		 309 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3389  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 799 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 429 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 308 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 947 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 550 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 1648 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  39.62 
 
 		 318 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4339  response regulator receiver protein  40 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 506 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 267 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.7 
 
 		 1483 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  48.08 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 251 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  36.23 
 
 		 884 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  36.84 
 
 		 919 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 981 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 285 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  35.85 
 
 		 268 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 957 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 900 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 254 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 252 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 222 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0051  LuxR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 247 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0498037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 309 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 963 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>