More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3389 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3389  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  426  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 241 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0276  two component transcription LuxR family regulatory protein  30.53 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00306595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  28.5 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  29.17 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  26.42 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.52 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  29.63 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  29.41 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  28.35 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  28.27 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  30.26 
 
 		 1483 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  26.7 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  30.51 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  28.42 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  26.18 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  28.27 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  26.7 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  25.51 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  28.57 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  27 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  27 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.26 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.04 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  25.65 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  27.32 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  25.65 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.94 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  26.6 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  26.26 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  26.7 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.77 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  27.78 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  26.42 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  27.89 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  27.23 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>