113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2898 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2898  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3181  sigma-70, region 4 type 2  37.14 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0394  regulatory protein, LuxR  32 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0417194  normal  0.0540308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1238  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3331  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 429 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573332  normal  0.222542 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  34.85 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3452  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 227 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  hitchhiker  0.00000787423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  40.74 
 
 		 214 aa  47.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8454  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  hitchhiker  0.00000372445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.62 
 
 		 922 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.62 
 
 		 921 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.62 
 
 		 921 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.62 
 
 		 921 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 250 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  33.8 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 243 aa  44.3  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 265 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2486  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  44.23 
 
 		 919 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2542  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  38.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  38.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  38.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  38.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  38.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  33.82 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  35.94 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0205  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  30.43 
 
 		 913 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 246 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 474 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 522 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  38.18 
 
 		 399 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 206 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 995 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  37.5 
 
 		 206 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 262 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 207 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  38.6 
 
 		 207 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 237 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 243 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 237 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 256 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  35 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 257 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 305 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 878 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 204 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  40.38 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  39.71 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  39.71 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  36.84 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 204 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>