More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0857 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 306 aa  603  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.52 
 
 		 333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.49 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.73 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.2 
 
 		 342 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.23 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.6 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.22 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.74 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.71 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.94 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.91 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.07 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.07 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.07 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.04 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.87 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  37.7 
 
 		 325 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  38.87 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.57 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.56 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.56 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  43.33 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  36 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.31 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.24 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.72 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.24 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  38.76 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.24 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.02 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.06 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.07 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.1 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  40.6 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.22 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  37.34 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.43 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.12 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.93 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.06 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.2 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  36.81 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.04 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.04 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.14 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.09 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.28 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.53 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.28 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  38.78 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.87 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.06 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.05 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.44 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.98 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.09 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.24 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  37.24 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.09 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  35.76 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.24 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.24 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.47 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  36.48 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.79 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.79 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.63 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.31 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.22 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.29 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.54 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.27 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.27 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.39 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  35 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.16 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.86 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  35.39 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.29 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.97 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.09 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  35.86 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.56 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.42 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  35.2 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.39 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.91 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.28 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.77 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  32.61 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.54 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.54 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.69 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.47 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>