More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1852 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.55 
 
 
313 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.19 
 
 
315 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  56.13 
 
 
316 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  58.88 
 
 
316 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  59.14 
 
 
315 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  59.42 
 
 
320 aa  351  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.89 
 
 
316 aa  338  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.22 
 
 
319 aa  319  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  53.57 
 
 
321 aa  318  7e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.48 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.1 
 
 
325 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  52.86 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.47 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  51.85 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  49.69 
 
 
318 aa  300  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  48.72 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.72 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  46.84 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49 
 
 
309 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.45 
 
 
317 aa  265  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.59 
 
 
319 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  45.12 
 
 
313 aa  238  9e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.72 
 
 
338 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  43.83 
 
 
311 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.93 
 
 
311 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.63 
 
 
319 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  41.04 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.08 
 
 
328 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.45 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.85 
 
 
316 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.58 
 
 
323 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.19 
 
 
331 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.14 
 
 
314 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.61 
 
 
331 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.22 
 
 
331 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.66 
 
 
332 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.13 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.62 
 
 
328 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.54 
 
 
324 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  35.52 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.02 
 
 
338 aa  198  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.03 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.99 
 
 
335 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.62 
 
 
329 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.06 
 
 
319 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.11 
 
 
328 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.23 
 
 
323 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.11 
 
 
328 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.56 
 
 
342 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.3 
 
 
325 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.66 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.71 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  37.29 
 
 
316 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.78 
 
 
354 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.35 
 
 
342 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.34 
 
 
331 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.3 
 
 
324 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.71 
 
 
330 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.3 
 
 
324 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.08 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.35 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.85 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.76 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.08 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.76 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.76 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 
323 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 
380 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.6 
 
 
345 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.47 
 
 
315 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.01 
 
 
325 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 
345 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  32.4 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.56 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.81 
 
 
311 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.75 
 
 
312 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.95 
 
 
321 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  37.14 
 
 
328 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
325 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.26 
 
 
334 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.23 
 
 
355 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.41 
 
 
326 aa  175  9e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.23 
 
 
355 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.24 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.19 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.23 
 
 
378 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.24 
 
 
363 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 
363 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.6 
 
 
325 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  32.78 
 
 
365 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 
386 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.69 
 
 
364 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.06 
 
 
323 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.71 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.69 
 
 
364 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.59 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  35.31 
 
 
364 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>