More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0958 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 324 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.59 
 
 		 319 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  68.34 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.56 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.16 
 
 		 325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.85 
 
 		 319 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.25 
 
 		 327 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.31 
 
 		 327 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  68.65 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.59 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  69.91 
 
 		 319 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.65 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  68.34 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.91 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  68.65 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.22 
 
 		 319 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.65 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.91 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  71.25 
 
 		 327 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.28 
 
 		 319 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.19 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.57 
 
 		 333 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.39 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.88 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.94 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.39 
 
 		 335 aa  361  8e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.38 
 
 		 315 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.57 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.45 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.06 
 
 		 322 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.25 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.44 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.44 
 
 		 322 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.06 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  57.76 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.32 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  57.45 
 
 		 322 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.88 
 
 		 329 aa  345  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.52 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.94 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.79 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.07 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.45 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.33 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.45 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.75 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.9 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.56 
 
 		 319 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.76 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  54.43 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  57.05 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.43 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  56.88 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  58.75 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.83 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.83 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.43 
 
 		 323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.82 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.55 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.32 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.39 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.52 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.92 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.8 
 
 		 322 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  47 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  52.19 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  51.72 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.5 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.41 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.02 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.71 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.68 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  51.89 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  49.68 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.37 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  43.93 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.71 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.57 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.41 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.32 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.17 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.33 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.09 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  40.75 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.86 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.53 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.91 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.44 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.12 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.28 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.07 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.07 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.64 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.24 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.24 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.19 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.25 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>