More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6828 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
325 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.36 
 
 
332 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.3 
 
 
331 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.49 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.85 
 
 
329 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.52 
 
 
332 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.14 
 
 
325 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.1 
 
 
323 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.54 
 
 
332 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.54 
 
 
332 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.54 
 
 
332 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.99 
 
 
325 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.89 
 
 
330 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.69 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.69 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.66 
 
 
323 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.47 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.16 
 
 
324 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  61.76 
 
 
324 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.62 
 
 
342 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.88 
 
 
325 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.04 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.56 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.24 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.78 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.86 
 
 
328 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.5 
 
 
323 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.18 
 
 
326 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.18 
 
 
326 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.69 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.32 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.68 
 
 
330 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.87 
 
 
325 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.73 
 
 
324 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  61.01 
 
 
328 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.54 
 
 
328 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60 
 
 
339 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  60.92 
 
 
334 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.99 
 
 
327 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.73 
 
 
324 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  51.56 
 
 
346 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  51.63 
 
 
340 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.59 
 
 
319 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  53.78 
 
 
269 aa  256  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.22 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.94 
 
 
322 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.77 
 
 
313 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  40.45 
 
 
314 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 
278 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.38 
 
 
309 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 
323 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.1 
 
 
326 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.94 
 
 
315 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.51 
 
 
317 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.46 
 
 
316 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.09 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.56 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  39.72 
 
 
311 aa  195  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.05 
 
 
313 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.84 
 
 
314 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  36.61 
 
 
321 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  37.3 
 
 
317 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.42 
 
 
319 aa  188  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.98 
 
 
386 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.87 
 
 
316 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.15 
 
 
319 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.73 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.19 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.65 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.06 
 
 
325 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  36.94 
 
 
321 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.65 
 
 
312 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.42 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.03 
 
 
314 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.03 
 
 
314 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.18 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.99 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.08 
 
 
313 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.25 
 
 
311 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.91 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  37.01 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.21 
 
 
305 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.96 
 
 
305 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.47 
 
 
354 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.92 
 
 
355 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.59 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.82 
 
 
314 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.23 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
353 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  32.01 
 
 
361 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 
369 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.18 
 
 
336 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.67 
 
 
315 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.66 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.29 
 
 
356 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.62 
 
 
326 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  30.68 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.32 
 
 
326 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.46 
 
 
356 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>