More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3140 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 317 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.67 
 
 		 318 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.03 
 
 		 321 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  83.28 
 
 		 318 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  82.97 
 
 		 318 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  82.5 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  81.59 
 
 		 319 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.86 
 
 		 317 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.4 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  77.99 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  78.73 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.97 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.28 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.72 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.78 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.43 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.03 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  72.4 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.83 
 
 		 315 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  68.51 
 
 		 322 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  69.03 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.95 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  71.7 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  68.71 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.7 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.7 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.43 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.77 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  61.71 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.98 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.83 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.75 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.1 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.09 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.84 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.42 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.08 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  63.61 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  63.61 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  63.61 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  63.61 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.97 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  68.93 
 
 		 321 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.54 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.03 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.03 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.66 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.89 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.71 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.71 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.51 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.44 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.26 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.39 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.95 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.8 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  62.7 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.17 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.57 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.52 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.67 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.36 
 
 		 322 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.48 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.34 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.84 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.96 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  49.84 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  47.94 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.67 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  49.34 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.01 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  40 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.89 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.9 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.3 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.35 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.42 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.36 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.06 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.53 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.32 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  47.13 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.56 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.48 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.43 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  38.31 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.17 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.62 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.03 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.54 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  28.21 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.75 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.67 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.15 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  33 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.82 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.37 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.03 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>