More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1779 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
377 aa  762    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.47 
 
 
380 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.51 
 
 
380 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  37.14 
 
 
364 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  37.14 
 
 
364 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.17 
 
 
378 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  37.02 
 
 
365 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.58 
 
 
363 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  35.73 
 
 
363 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  36.88 
 
 
364 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  36.88 
 
 
364 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  36.36 
 
 
364 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  36.36 
 
 
364 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  36.58 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.03 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.62 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  35.99 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 
374 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 
374 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.29 
 
 
374 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.22 
 
 
373 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.29 
 
 
367 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.1 
 
 
378 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.15 
 
 
383 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.39 
 
 
373 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.09 
 
 
373 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.42 
 
 
369 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.64 
 
 
367 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.15 
 
 
317 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 
373 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.51 
 
 
323 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.03 
 
 
373 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 
373 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31 
 
 
355 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31 
 
 
355 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.25 
 
 
378 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  37.23 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.39 
 
 
354 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.33 
 
 
376 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.84 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  34.39 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.42 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.72 
 
 
331 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.6 
 
 
326 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.23 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.98 
 
 
315 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.42 
 
 
338 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.05 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.1 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.1 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.1 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.13 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.55 
 
 
362 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.36 
 
 
377 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.87 
 
 
378 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.31 
 
 
316 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.44 
 
 
376 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  34.56 
 
 
383 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  33.94 
 
 
378 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.6 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.47 
 
 
363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  34.13 
 
 
350 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  33.25 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.5 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.71 
 
 
316 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.39 
 
 
368 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  39.68 
 
 
321 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.61 
 
 
309 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.71 
 
 
353 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.84 
 
 
353 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.65 
 
 
359 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 
371 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.9 
 
 
364 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.2 
 
 
323 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  32.55 
 
 
409 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.71 
 
 
375 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.2 
 
 
313 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.92 
 
 
317 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.91 
 
 
354 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.48 
 
 
381 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.72 
 
 
314 aa  150  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.72 
 
 
314 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.2 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.5 
 
 
366 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.12 
 
 
366 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.08 
 
 
345 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  32.46 
 
 
346 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.2 
 
 
314 aa  146  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  29.78 
 
 
359 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.28 
 
 
329 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.02 
 
 
367 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.84 
 
 
346 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.15 
 
 
351 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.93 
 
 
361 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  31.58 
 
 
347 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.99 
 
 
344 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.49 
 
 
372 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.17 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.62 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  37.93 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>