More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1526 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 355 aa  717    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  44.01 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.23 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.12 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.97 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.75 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.97 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.43 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  36.07 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.83 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.57 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.66 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.44 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.44 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.44 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.31 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.08 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.93 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.71 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.36 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.08 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.42 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.75 
 
 		 325 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.14 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  34.65 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.78 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.21 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.9 
 
 		 354 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.48 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.53 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.91 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34.03 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  32.28 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.76 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.71 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.09 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.9 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.38 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.72 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.67 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.43 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.95 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.11 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.01 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.56 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.13 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.35 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.15 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.88 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.01 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.1 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.48 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.94 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.33 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.99 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.94 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.64 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.91 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.94 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.18 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.33 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.46 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.62 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  37.11 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.88 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.16 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.84 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  34.68 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.12 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.06 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.9 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  31.12 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  35.94 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.86 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.71 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.05 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.29 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  40.48 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.76 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 		 345 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.33 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  34.38 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  29.78 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.43 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.88 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.17 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.49 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.93 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>