More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2812 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.43 
 
 		 295 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.27 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.82 
 
 		 323 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.49 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.77 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.06 
 
 		 322 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.88 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.17 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.86 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.35 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  65.37 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.46 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.27 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.24 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.7 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.7 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.42 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  64.74 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  64.74 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.26 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  66.67 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  65.03 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.52 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.33 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.56 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.85 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.17 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.3 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.81 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.22 
 
 		 322 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.03 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.03 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.39 
 
 		 335 aa  358  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.26 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.44 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  57.64 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.96 
 
 		 319 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  63.34 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.55 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.9 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.97 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.33 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.33 
 
 		 325 aa  332  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.37 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.01 
 
 		 319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.02 
 
 		 335 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.94 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  57.01 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.02 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.77 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  58.25 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  56.69 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.69 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.05 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.05 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.05 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  56.69 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.73 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.41 
 
 		 319 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.41 
 
 		 319 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.23 
 
 		 342 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  53 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47 
 
 		 321 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.9 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.91 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.39 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  49.51 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  51.27 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.34 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.16 
 
 		 318 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.32 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  50.49 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.57 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.87 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  46.77 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.45 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.04 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.47 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.16 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.12 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.87 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.51 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.38 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  40.65 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  39.3 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.55 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.89 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.94 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.42 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.46 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.92 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  28 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.14 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  25.65 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.85 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  24.71 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.28 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>