More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1299 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  100 
 
 		 321 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.99 
 
 		 318 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.56 
 
 		 318 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  79.56 
 
 		 318 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  79 
 
 		 319 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.93 
 
 		 317 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.99 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  75.79 
 
 		 320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.54 
 
 		 338 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  78.12 
 
 		 318 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  74.76 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  69.5 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.61 
 
 		 329 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.79 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.83 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.62 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.32 
 
 		 335 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.63 
 
 		 322 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  71.25 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.21 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.21 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  72.73 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.27 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.62 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.85 
 
 		 319 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  67.39 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.62 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  67.7 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.69 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.75 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.19 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  61.88 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.98 
 
 		 320 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.19 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.27 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.47 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.86 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  68.54 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.5 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.19 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.19 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.19 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.25 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  61.88 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.56 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.56 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  61.99 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.56 
 
 		 319 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  61.99 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  61.99 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.07 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.25 
 
 		 336 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.13 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.83 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.03 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.12 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.81 
 
 		 325 aa  361  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  61.13 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.74 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.05 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.18 
 
 		 342 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.13 
 
 		 322 aa  328  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.26 
 
 		 295 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.04 
 
 		 321 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.07 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.98 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.12 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  48.45 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  49.06 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.75 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.75 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.69 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.44 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  48.43 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.85 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.2 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  41.85 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.27 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.34 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.2 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.77 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.52 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.44 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.63 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.26 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  39.37 
 
 		 322 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.8 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.58 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.24 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.39 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.72 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.45 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  26.94 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.79 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.23 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.3 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  30.48 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.19 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>