More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0801 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08460  hypothetical protein  94.41 
 
 		 322 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000270862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5104  2-nitropropane dioxygenase, NPD  82.61 
 
 		 322 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3935  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.37 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0460  2-nitropropane dioxygenase NPD  78.68 
 
 		 318 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4773  2-nitropropane dioxygenase NPD  79.31 
 
 		 318 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0430  hypothetical protein  79.31 
 
 		 318 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0463  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.68 
 
 		 318 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3014  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.67 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4072  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.19 
 
 		 324 aa  350  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0432  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.6 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4276  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.29 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.73 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00157568  hitchhiker  0.00722114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.64 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1252  2-nitropropane dioxygenase-like protein  57.96 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0307  hypothetical protein  57.23 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2689  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.44 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0357  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  56.92 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0536  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.92 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0345  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  56.92 
 
 		 319 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0157  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.97 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2965  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.35 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2986  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.35 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6315  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.35 
 
 		 319 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2351  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.35 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2876  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.03 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.03 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2961  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.24 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6087  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.45 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1749  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.54 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.0608079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1057  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.41 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0824  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.63 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.846459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3628  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.42 
 
 		 335 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0268  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.72 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141203  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5349  2-nitropropane dioxygenase NPD  55 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4046  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.56 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0958  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.72 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.86 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0316  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.54 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0115  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.05 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1226  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.48 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0831  2-nitropropane dioxygenase family protein  51.26 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.04 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0779  2-nitropropane dioxygenase family protein  51.57 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.59 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0255  hypothetical protein  52.19 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0103  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.42 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.47 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0096  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.74 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5189  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.17 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5259  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.09 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0164  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.47 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2707  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.55 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.67 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145126  normal  0.697248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0960  putative dioxygenase  47.48 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0866  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.86 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0425  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.16 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0260  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.42 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3740  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.91 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4817  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.91 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2807  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.9 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3140  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.94 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0244863  normal  0.0100241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5592  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.5 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2296  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.74 
 
 		 318 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1299  putative transmembrane protein  48.45 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0174  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.42 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05452  putative transmembrane protein  50.94 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3674  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.87 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42160  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  45.98 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0716882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0500  hypothetical protein  51.74 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2394  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.09 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2171  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.02 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.85 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000431294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1960  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.35 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0974  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.461491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2090  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.69 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58265  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1056  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.18 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0838635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6742  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.67 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000550244  normal  0.521787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2812  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.49 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.33568  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0438  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.05 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0148802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2537  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.32 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000289542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4177  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.67 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.68 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3496  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.37 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3371  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.96 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1870  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.224001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1586  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.91 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2823  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.25 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0467554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1695  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.08 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0347  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.75 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0857  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.6 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.74 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  26.57 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.77 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.87 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.87 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.42 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.49 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.84 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>