More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29164 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_29164  cis-prenyltransferase involved in dolichol synthesis  100 
 
 
318 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225728  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41956  predicted protein  44.49 
 
 
343 aa  209  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  37.4 
 
 
311 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
252 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  36.96 
 
 
268 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03430  prenyltransferase, putative  35.93 
 
 
245 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.91 
 
 
257 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  38.84 
 
 
268 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05600  prenyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11350)  41.18 
 
 
403 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 
258 aa  155  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.53 
 
 
251 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 
252 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
252 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 
252 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.99 
 
 
252 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.79 
 
 
248 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  39.09 
 
 
248 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.27 
 
 
292 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.81 
 
 
286 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
243 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.45 
 
 
248 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.39 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.52 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.37 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  38.01 
 
 
254 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 
280 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.67 
 
 
249 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.76 
 
 
283 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.14 
 
 
252 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  38.2 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  39.81 
 
 
247 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  37.79 
 
 
261 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  35.84 
 
 
275 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
251 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  39.81 
 
 
247 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.67 
 
 
249 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
261 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 
271 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 
256 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  35.5 
 
 
258 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 
264 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.19 
 
 
248 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  36.16 
 
 
264 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.87 
 
 
279 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.17 
 
 
252 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.36 
 
 
255 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  33.47 
 
 
263 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 
240 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
278 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 
251 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.89 
 
 
252 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  36.12 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.01 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  39.73 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  39.73 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.86 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 
251 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  36.89 
 
 
252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.94 
 
 
236 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  35.65 
 
 
251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  35.65 
 
 
251 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  36.2 
 
 
228 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  36.87 
 
 
240 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.76 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.36 
 
 
254 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.5 
 
 
252 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.33 
 
 
251 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 
246 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.4 
 
 
255 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  35.34 
 
 
255 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  38.99 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  36.99 
 
 
260 aa  139  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.99 
 
 
282 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.32 
 
 
258 aa  139  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.2 
 
 
244 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.04 
 
 
236 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  37.96 
 
 
259 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 
264 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  35.65 
 
 
262 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.9 
 
 
254 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  34.31 
 
 
251 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  35.27 
 
 
255 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  38.32 
 
 
228 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.9 
 
 
269 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.75 
 
 
264 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2846  undecaprenyl diphosphate synthase  35.91 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.02 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  38.57 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  31.58 
 
 
250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  35.65 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  35.22 
 
 
251 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>