More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1533 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  93.65 
 
 
252 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  78.06 
 
 
268 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  51.43 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.84 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 
251 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 
251 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 
251 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  53.16 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.34 
 
 
251 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.34 
 
 
251 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 
251 aa  254  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.27 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.28 
 
 
252 aa  251  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.07 
 
 
248 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.54 
 
 
252 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  53.06 
 
 
251 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
256 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
254 aa  245  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
261 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
262 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
251 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  46.89 
 
 
261 aa  234  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
251 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.76 
 
 
285 aa  229  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.52 
 
 
256 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.61 
 
 
260 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  45.83 
 
 
256 aa  228  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2593  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.71 
 
 
249 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0126809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  48.55 
 
 
243 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.94 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  45.49 
 
 
274 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
257 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.19 
 
 
257 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  42.32 
 
 
276 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.96 
 
 
256 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  45.15 
 
 
264 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.53 
 
 
261 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
253 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.99 
 
 
253 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  45.92 
 
 
253 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
253 aa  222  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
253 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
253 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.12 
 
 
251 aa  221  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
282 aa  221  8e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
260 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.26 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  43.6 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.15 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.86 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
253 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.86 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.86 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.61 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.03 
 
 
275 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
272 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
238 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
248 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
253 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
241 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.03 
 
 
275 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.03 
 
 
275 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  43.5 
 
 
263 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
260 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
247 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  44.87 
 
 
271 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  40.76 
 
 
276 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  44.22 
 
 
253 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>