187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_1682 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_1682  anthranilate synthase. anthranilate synthetase. chorismate lyase  100 
 
 		 437 aa  904    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0944619  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60468  U3 snoRNA associated protein  31.74 
 
 		 563 aa  232  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0541786 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07458  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05930)  28.06 
 
 		 579 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00040  WD-repeat protein, putative  27.99 
 
 		 622 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0839443  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119571  WD-repeat protein  25.97 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1477 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1190 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 		 1163 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.29 
 
 		 1242 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.32 
 
 		 1652 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1304 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1553 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.88 
 
 		 1481 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1510 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 1363 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.15 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.23 
 
 		 675 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  40 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 		 1208 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.73 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.75 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.32 
 
 		 1357 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.4 
 
 		 1236 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1399 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.25 
 
 		 1330 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1213 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.26 
 
 		 1484 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.79 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.24 
 
 		 1599 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 		 1188 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 1686 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1552 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.55 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 1221 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.19 
 
 		 1474 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.54 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.69 
 
 		 1334 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.68 
 
 		 1364 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  21.56 
 
 		 1016 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1196 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.05 
 
 		 1901 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 914 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 		 1344 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  21.13 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1367 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 		 960 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 		 1161 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  21.56 
 
 		 1016 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.57 
 
 		 1229 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.72 
 
 		 1188 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  26.88 
 
 		 872 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1117 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 762 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1214 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.33 
 
 		 1760 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1807 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1427 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.72 
 
 		 865 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.08 
 
 		 1262 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 		 1311 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.48 
 
 		 1443 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 		 1411 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 		 1348 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  27.14 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.25 
 
 		 636 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.3 
 
 		 1217 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  18.75 
 
 		 1831 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1557 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.01 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  24.59 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  24.34 
 
 		 248 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.1 
 
 		 664 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  28.87 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.75 
 
 		 1823 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.27 
 
 		 1856 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  31.82 
 
 		 597 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.89 
 
 		 608 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1264 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.11 
 
 		 1164 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.73 
 
 		 677 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  20.97 
 
 		 891 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1264 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  27.2 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  32.1 
 
 		 826 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  29.57 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  29.57 
 
 		 363 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.88 
 
 		 1711 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.77 
 
 		 1004 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1247 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.29 
 
 		 1699 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.66 
 
 		 943 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.7 
 
 		 1205 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 994 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.94 
 
 		 1684 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>