86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60468 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60468  U3 snoRNA associated protein  100 
 
 		 563 aa  1159    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0541786 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07458  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05930)  37.6 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1682  anthranilate synthase. anthranilate synthetase. chorismate lyase  31.96 
 
 		 437 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0944619  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00040  WD-repeat protein, putative  28.46 
 
 		 622 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0839443  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119571  WD-repeat protein  26.65 
 
 		 411 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.94 
 
 		 1217 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.97 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 1190 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.36 
 
 		 1188 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.88 
 
 		 1163 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  34.23 
 
 		 1157 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 1760 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 1221 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  22.88 
 
 		 344 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 		 1183 aa  55.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1807 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1152 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 		 1240 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.07 
 
 		 1711 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22.05 
 
 		 344 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.28 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1477 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.91 
 
 		 1557 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.9 
 
 		 1364 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  33.07 
 
 		 1208 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.27 
 
 		 1510 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1196 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.18 
 
 		 1363 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.29 
 
 		 930 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.15 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 1334 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.52 
 
 		 1523 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 565 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1858 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  31.53 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.93 
 
 		 1348 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.96 
 
 		 1076 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1552 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 954 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.97 
 
 		 1481 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1041 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 1474 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1236 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.11 
 
 		 1205 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.61 
 
 		 664 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.74 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  26.46 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.07 
 
 		 1039 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  22.41 
 
 		 1766 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1304 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.1 
 
 		 1623 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.69 
 
 		 1262 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  25.45 
 
 		 306 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 		 1193 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  20.87 
 
 		 1661 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.65 
 
 		 675 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.49 
 
 		 742 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1789 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  32.73 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.02 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.85 
 
 		 1161 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.75 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.81 
 
 		 1901 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  20.13 
 
 		 316 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  21.82 
 
 		 1878 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.62 
 
 		 1652 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  22.38 
 
 		 782 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41144  predicted protein  28.99 
 
 		 1295 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16252  normal  0.0548409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  23 
 
 		 960 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 461 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.32 
 
 		 1357 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1230 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.07 
 
 		 919 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28 
 
 		 792 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  19.8 
 
 		 1454 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.86 
 
 		 1256 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.09 
 
 		 576 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.5 
 
 		 596 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.45 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.25 
 
 		 1267 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  20.95 
 
 		 1164 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  21.07 
 
 		 1176 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>