17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119571 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119571  WD-repeat protein  100 
 
 
411 aa  848    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1682  anthranilate synthase. anthranilate synthetase. chorismate lyase  25.97 
 
 
437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0944619  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60468  U3 snoRNA associated protein  26.65 
 
 
563 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0541786 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07458  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05930)  25.14 
 
 
579 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00040  WD-repeat protein, putative  26.7 
 
 
622 aa  77  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0839443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.13 
 
 
1858 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  19.21 
 
 
1652 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.71 
 
 
1711 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.38 
 
 
1190 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  20.17 
 
 
1242 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.82 
 
 
1686 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 
1188 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 
1491 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.89 
 
 
1760 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.17 
 
 
576 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  20.23 
 
 
687 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  23.05 
 
 
1280 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>