20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00040 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00040  WD-repeat protein, putative  100 
 
 		 622 aa  1257    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0839443  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60468  U3 snoRNA associated protein  28.95 
 
 		 563 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0541786 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07458  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05930)  28.83 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1682  anthranilate synthase. anthranilate synthetase. chorismate lyase  28.11 
 
 		 437 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0944619  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119571  WD-repeat protein  26.7 
 
 		 411 aa  87  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1157 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 1831 aa  53.9  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1152 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 		 1161 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 1334 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30495  predicted protein  23.98 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.99 
 
 		 1208 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  26.63 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.46 
 
 		 1357 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.97 
 
 		 1190 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1661 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  29.01 
 
 		 347 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1304 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.73 
 
 		 1652 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>