134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48471 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48471  predicted protein  100 
 
 
495 aa  1035    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00174392  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  28.75 
 
 
1731 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48951  predicted protein  25.16 
 
 
445 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.37 
 
 
1404 aa  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.44 
 
 
825 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 
1040 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.06 
 
 
1328 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.16 
 
 
694 aa  90.1  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
454 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
843 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.72 
 
 
919 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.06 
 
 
740 aa  86.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
1435 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
568 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 
1186 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 
568 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
1215 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.52 
 
 
767 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
924 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.51 
 
 
2145 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
1105 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.57 
 
 
732 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42762  predicted protein  24.29 
 
 
713 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.630587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
814 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.34 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 
919 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  21.31 
 
 
828 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
911 aa  80.5  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 
787 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.79 
 
 
725 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 
991 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.08 
 
 
493 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.44 
 
 
1550 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.67 
 
 
1212 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.66 
 
 
822 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.85 
 
 
1039 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.26 
 
 
885 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  22.68 
 
 
708 aa  73.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  21.46 
 
 
1507 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.42 
 
 
771 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.59 
 
 
2327 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  20.34 
 
 
1056 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
1088 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 
1424 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  22.9 
 
 
807 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  22.16 
 
 
1288 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
751 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  22.48 
 
 
1068 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  22.67 
 
 
686 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
949 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.02 
 
 
854 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.11 
 
 
2413 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.62 
 
 
1228 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.53 
 
 
799 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.27 
 
 
1262 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  23.2 
 
 
1475 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  21.41 
 
 
1131 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  21.94 
 
 
836 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
953 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  21.35 
 
 
1128 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.74 
 
 
362 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
857 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
639 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
669 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  21.54 
 
 
576 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  23.74 
 
 
311 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48337  predicted protein  24.04 
 
 
678 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 
1290 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  21.72 
 
 
1106 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
190 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  19.76 
 
 
1044 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  24.34 
 
 
212 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
837 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.18 
 
 
1488 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  21.7 
 
 
977 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
785 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  26.4 
 
 
702 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  22.13 
 
 
680 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
667 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54586  hypothetical protein  28.37 
 
 
1525 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
900 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.02 
 
 
1050 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  20.67 
 
 
1185 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
1162 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
851 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  17.89 
 
 
731 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
1162 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
1409 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.75 
 
 
1036 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 
992 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  23.89 
 
 
236 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
776 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  29.08 
 
 
793 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.44 
 
 
626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
1266 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>