273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2093 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  49.08 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  35.61 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  35.97 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 379 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  34.17 
 
 		 517 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.17 
 
 		 356 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.29 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  32.42 
 
 		 363 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  31.49 
 
 		 351 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.17 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  33.9 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  34.68 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.2 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.26 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 304 aa  72  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  30.68 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2668  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.44 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2895  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  31.28 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.75 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  30 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2784  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.151329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  31.82 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.67 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  28 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.99 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.34 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 682 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.87 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  30 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  25 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 360 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  25.32 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.08 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2790  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.578873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.79 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2366  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  22.41 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  22.49 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  22.49 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  26.29 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  32.04 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>