272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5796 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5796  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  833    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.199495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  57.71 
 
 		 905 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000234438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 864 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 754 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 879 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 880 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 863 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4625  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.27 
 
 		 915 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 850 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0845  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.3 
 
 		 879 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0764  GGDEF domain-containing protein  28.57 
 
 		 905 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4644  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.37 
 
 		 904 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.374969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4485  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.35 
 
 		 907 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.68 
 
 		 738 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7687  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.63 
 
 		 1047 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327995  normal  0.497822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3139  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.91 
 
 		 764 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.423173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1165  diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.77 
 
 		 883 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.660449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4136  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.49 
 
 		 630 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138733  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  27.63 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 		 1018 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  28.18 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  26.61 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  25.49 
 
 		 683 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  26.49 
 
 		 515 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  29.43 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 1253 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  27.1 
 
 		 533 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  26.8 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  26.8 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.52 
 
 		 996 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  29.31 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 1135 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 973 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 516 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 522 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1912  diguanylate cyclase  26.27 
 
 		 619 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.693506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  26.13 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  25.15 
 
 		 553 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  27.4 
 
 		 522 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  24.67 
 
 		 503 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 1350 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4799  hypothetical protein  25.26 
 
 		 867 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  25.62 
 
 		 515 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  26.3 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  26.44 
 
 		 512 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  24.84 
 
 		 508 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.06 
 
 		 858 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 474 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  25.32 
 
 		 508 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3460  GGDEF domain-containing protein  24.35 
 
 		 644 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0284505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  29.46 
 
 		 502 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 1021 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 969 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  28.06 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  27.78 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3250  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.62 
 
 		 768 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  27.74 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 756 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  27.74 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  29.54 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  24.93 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 		 636 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  26.32 
 
 		 494 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  23.42 
 
 		 512 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  29.96 
 
 		 509 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  27.68 
 
 		 502 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  25.86 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  25.51 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  26.32 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  26.32 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  29.44 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  27.9 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0740  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.84 
 
 		 698 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 705 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 707 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 510 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  26.36 
 
 		 506 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  25.6 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 717 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.32 
 
 		 1006 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0718  diguanylate cyclase  31.06 
 
 		 169 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 531 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 717 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  26.55 
 
 		 488 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  28.43 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2785  diguanylate cyclase  24.02 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  25.49 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  27.49 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  27.92 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  26.13 
 
 		 716 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  26.79 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  27.94 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>