More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3082 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
556 aa  1080    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.27714  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 
556 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
562 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
688 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 
688 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
688 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  43.21 
 
 
565 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
689 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  44.42 
 
 
688 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 
559 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
566 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.09 
 
 
568 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
561 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
566 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
656 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
568 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 
565 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
562 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
566 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 
562 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
673 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
741 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.45 
 
 
562 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.04 
 
 
573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.01 
 
 
565 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
567 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
561 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.11 
 
 
542 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 
563 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
674 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.77 
 
 
676 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
567 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
561 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
566 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
567 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
561 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 
561 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.84 
 
 
564 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
561 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
672 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
561 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.32 
 
 
572 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
565 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0370  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
560 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
561 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 
730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 
602 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
670 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
568 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.1 
 
 
655 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.2 
 
 
561 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
561 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
731 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
641 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
674 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
562 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
556 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  40.89 
 
 
563 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
656 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
566 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
587 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
674 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
556 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
558 aa  239  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 
564 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
558 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 
563 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
686 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 
563 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
556 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
649 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
714 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 
562 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 
608 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 
712 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 
577 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2961  hypothetical protein  34.81 
 
 
561 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.638324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
538 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
656 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 
563 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
565 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  41.43 
 
 
688 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0667  chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.510632  normal  0.195802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
575 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
563 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
564 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315031  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 
563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
558 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 
838 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 
694 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 
681 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>