156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0565 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0565  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  903    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0600  hypothetical protein  59.05 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5010  hypothetical protein  57.6 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3611  hypothetical protein  58.91 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.426846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3438  hypothetical protein  60.14 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0457  hypothetical protein  56.43 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.734895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0466  hypothetical protein  56.21 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3538  hypothetical protein  56.14 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000073392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0783  hypothetical protein  50.93 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5035  hypothetical protein  51.56 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1155  hypothetical protein  50.98 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0965806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2984  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.37 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2770  hypothetical protein  44.37 
 
 		 441 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0552  hypothetical protein  45.48 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0264  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  46.34 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43510  hypothetical protein  44.02 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0230529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0253  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  42.5 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0750632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0218  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  43.17 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2721  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  43.27 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178646  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2987  hypothetical protein  43.84 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43720  hypothetical protein  43.94 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  45.21 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5149  hypothetical protein  41.04 
 
 		 444 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2547  hypothetical protein  44.32 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2275  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  45.01 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  45.01 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2752  hypothetical protein  41.97 
 
 		 444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43750  hypothetical protein  41.84 
 
 		 444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.675363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3494  hypothetical protein  43.02 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3001  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.49 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3802  hypothetical protein  42.79 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0052  Fis family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 426 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0380  high-affinity branched-chain amino acid transport system periplasmic binding protein livK  43.52 
 
 		 426 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1435  hypothetical protein  41.15 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  hitchhiker  0.00000490769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2751  hypothetical protein  42.35 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.49 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3876  hypothetical protein  43 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43730  hypothetical protein  42.92 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4295  hypothetical protein  39.33 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  decreased coverage  0.00229611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7159  hypothetical protein  43.54 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0119  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein, putative  41.07 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7160  hypothetical protein  39.86 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4004  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein  39.02 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.91 
 
 		 418 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2949  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.98 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0366338  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5205  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  20.85 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.75 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.02 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  21.93 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.57 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3506  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  24.45 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2445  Extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4065  extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3413  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  20.8 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0300  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  22.77 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.652614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3133  putative branched-chain amino acid ABC transporter  21.93 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.401616  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1835  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  22.25 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2607  putative branched-chain amino acid ABC transporter  22 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.46 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  20.77 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  25.19 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2305  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  22.28 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1556  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  22.77 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4575  ABC transporter substrate-binding protein  23.63 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1566  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.21 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  22.08 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000400  ABC transporter substrate-binding protein  22.51 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  24.44 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.74 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.22 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  21.53 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5718  branched-chain amino acid ABC transporter  22.78 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.22 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.11 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4179  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  22.36 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  21.13 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>