More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0178 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0178  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0057  hypothetical protein  26.71 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0055  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06260  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308123  normal  0.145947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2849  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.794351  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  26.35 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.37 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  26.54 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  23.19 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  25.63 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  26.84 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  25.55 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0169  transcriptional regulator, LysR family  24.21 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0402  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  25.63 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0137  LysR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.15 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  24.05 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2002  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0975568  hitchhiker  0.000333311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2061  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159337  hitchhiker  0.000037985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  26.15 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1974  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00037862  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2204  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2000  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000154279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2202  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000614587  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2312  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0007989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2167  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000280359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2374  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0155  transcriptional regulator, LysR family  23.36 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>