More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1535 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  99 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  98.99 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  96.6 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 299 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 299 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 299 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  80.07 
 
 		 298 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2849  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.794351  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0178  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06260  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308123  normal  0.145947 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0057  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0055  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  32.78 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.09 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.6 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  30.03 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  32.56 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4696  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.580635  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  27.8 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  28.95 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4922  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0300  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  29.64 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  29.64 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  29.64 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  29.64 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  29.64 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3477  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  28.47 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4333  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00415  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.88 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>