More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1130 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  67.69 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  39.92 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  37.69 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  35.71 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  34.57 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5918  regulatory protein, LysR  57.69 
 
 		 114 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5553  regulatory protein, LysR  56.73 
 
 		 114 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4433  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  28.4 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  27.38 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  27.48 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06260  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308123  normal  0.145947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  26.67 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3576  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0297722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003833  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>