More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6422 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  89.49 
 
 		 313 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  87.33 
 
 		 321 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  87.46 
 
 		 315 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  64.98 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5918  regulatory protein, LysR  96.49 
 
 		 114 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5553  regulatory protein, LysR  95.61 
 
 		 114 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  40.31 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  41.15 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  34.36 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  33.2 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4433  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5842  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3401  LysR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 207 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.674925  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1037  LysR substrate-binding  31.5 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5095  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3141  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  27.38 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0300  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3337  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2849  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.794351  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.32 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  24.62 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>