More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2021 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  41.36 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 322 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  38.64 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  34.01 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.09 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0178  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 291 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0355  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  29.55 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3401  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.674925  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.67 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1422  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003833  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01849  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4003  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2710  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4116  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4323  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04791  putative transcription regulator protein  31.79 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0922  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>