More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0769 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  55.1 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 307 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.3 
 
 		 307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 308 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  55.05 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0700  putative transcriptional regulator  54.46 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  47.02 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  43.2 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  42.38 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  42.56 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  41.33 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  35.85 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5255  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443087  normal  0.0197845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4464  transcriptional regulator, LysR family  36.57 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  38.04 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  31.4 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.361847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  31.16 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  33.8 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2592  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  32.41 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  32.41 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  32.41 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  32.41 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.41 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.61 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3423  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3426  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0409161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3530  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3593  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.480915  normal  0.520178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3496  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02974  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0596  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05788  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02925  hypothetical protein  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4420  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0786567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3295  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3403  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0591  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3580  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>