More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2089 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4464  transcriptional regulator, LysR family  55.17 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5255  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443087  normal  0.0197845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 307 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  38.13 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.41 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  33.21 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0700  putative transcriptional regulator  37.54 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  32.85 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  31.29 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  31.82 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.16 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.32 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3395  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  26.32 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3521  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3426  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0409161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3423  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3496  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  29.68 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3593  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.480915  normal  0.520178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3530  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2592  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  29.08 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0596  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4420  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0786567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0591  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3295  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02974  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3580  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02925  hypothetical protein  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3403  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2465  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0542  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1117  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.3 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0478  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.3 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0518  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1422  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  26.49 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05788  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0736  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>