More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3395 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3395  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3521  transcriptional regulator, LysR family  92.23 
 
 		 298 aa  557  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0518  transcriptional regulator, LysR family  89.19 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0736  transcriptional regulator, LysR family  88.18 
 
 		 298 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02974  predicted DNA-binding transcriptional regulator  87.5 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0596  transcriptional regulator, LysR family  87.84 
 
 		 298 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02925  hypothetical protein  87.5 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3295  LysR family transcriptional regulator  87.84 
 
 		 298 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0591  LysR family transcriptional regulator  87.84 
 
 		 298 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3580  LysR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4420  transcriptional regulator, LysR family  87.84 
 
 		 298 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0786567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3403  LysR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 298 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3426  transcriptional regulator, LysR family  87.12 
 
 		 298 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0409161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3423  transcriptional regulator, LysR family  87.12 
 
 		 298 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3496  LysR family transcriptional regulator  87.12 
 
 		 298 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3593  LysR family transcriptional regulator  87.46 
 
 		 298 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.480915  normal  0.520178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3530  LysR family transcriptional regulator  87.12 
 
 		 298 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3558  LysR family transcriptional regulator  86.44 
 
 		 298 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0542  LysR family transcriptional regulator  85.47 
 
 		 297 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1117  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  85.47 
 
 		 297 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0478  LysR family substrate binding transcriptional regulator  85.47 
 
 		 297 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4333  LysR family transcriptional regulator  86.1 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0518  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000157  transcriptional regulator LysR family  47.04 
 
 		 295 aa  281  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05788  transcriptional regulator  44.6 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2209  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.54 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852985  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1459  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6369  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2407  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2013  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.706751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5812  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394289  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5596  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7006  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0901  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 335 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1489  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6340  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2580  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.64734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  37.63 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 359 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  35.89 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4888  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842782  hitchhiker  0.000000597964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4371  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120427  normal  0.0114569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0689  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  35.27 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2566  transcriptional regulator, LysR family protein  33.11 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.169801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  30.95 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2890  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2932  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1388  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0605197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 312 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2902  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 319 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.374405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3997  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4110  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1907  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3124  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2000  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.17 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000154279  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4168  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0180003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>