More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0700 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0700  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  61.59 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  59.34 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  58.65 
 
 		 307 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  58.31 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  44.64 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  44.33 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  45.73 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  44.98 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  46.84 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4464  transcriptional regulator, LysR family  42.44 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5255  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443087  normal  0.0197845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  40.37 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1027  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 294 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.361847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  33.1 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2592  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  31.03 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  34.62 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0518  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  29.5 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  30.77 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3521  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>