More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1835 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2580  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.64734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0901  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  50.72 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2209  transcriptional regulator transcription regulator protein  51.04 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852985  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2407  transcriptional regulator, LysR family  49.65 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2013  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.706751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5596  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7006  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1459  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6369  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1489  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5812  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394289  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6340  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  48.82 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 359 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4888  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842782  hitchhiker  0.000000597964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4371  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120427  normal  0.0114569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0689  LysR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2890  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  41.3 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2566  transcriptional regulator, LysR family protein  39.8 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.169801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3124  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1907  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1388  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0605197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2902  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.374405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4168  MarR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0180003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2932  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  39.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  39.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  39.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  39.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  39.3 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  35.89 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3695  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3997  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4110  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4846  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.59 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1739  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3521  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1810  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.54 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000533162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4047  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.900544  normal  0.0449817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2312  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0007989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2202  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000614587  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0518  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2167  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000280359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2204  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3250  MarR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2013  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000422246  normal  0.025363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.54 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0501585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1525  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.1 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1562  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.1 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1539  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.1 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000412761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1974  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.36 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00037862  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1745  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.1 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2000  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000154279  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1914  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.1 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000429246  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01630  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.75 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1739  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.75 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  9.075529999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3009  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 307 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3423  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3496  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01619  hypothetical protein  36.75 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>