More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  50.35 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  50.35 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  50.35 
 
 		 309 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1933  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 301 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0399555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2465  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  32.31 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2902  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.374405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4168  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0180003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4846  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.28 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3695  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  31.11 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1739  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5596  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.06 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3250  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4267  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287329  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4888  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842782  hitchhiker  0.000000597964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2580  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.64734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4371  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120427  normal  0.0114569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5812  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394289  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2209  transcriptional regulator transcription regulator protein  31.96 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852985  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.46 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3997  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4110  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4099  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2566  transcriptional regulator, LysR family protein  32.55 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.169801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2932  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0901  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2407  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1432  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1459  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6369  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3009  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  31.1 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2013  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.706751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7006  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>