More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7442 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  42.57 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  37.5 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.23 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0402  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3401  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 207 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.674925  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  31.89 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04791  putative transcription regulator protein  32.38 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  27.6 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4922  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  28.85 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01849  transcriptional regulator  30.31 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2710  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  27.93 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0169  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0055  hypothetical protein  28.33 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0300  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2275  regulatory protein LysR  32.66 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0355  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0195  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>