More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0195 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0195  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0169  transcriptional regulator, LysR family  76.33 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0155  transcriptional regulator, LysR family  78.64 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0137  LysR family transcriptional regulator  78.31 
 
 		 307 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0216  LysR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0402  LysR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 301 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2250  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.75776  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3488  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0702962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1724  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1881  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 292 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28420  LysR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1349  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000462626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4338  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2479  putative transcriptional regulator  48.75 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4696  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.580635  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0300  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4922  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4291  transcriptional regulator, LysR family  43.57 
 
 		 295 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.70034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1136  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1242  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3184  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0421  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1185  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5095  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3183  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3141  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3327  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5842  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4433  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1825  transcriptional regulator, LysR family protein  28.41 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.401328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3337  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  32.51 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1037  LysR substrate-binding  32.44 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3742  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2378  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4052  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1745  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2357  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1142  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1303  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0943  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  32.53 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1150  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.529975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2083  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2212  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2275  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0697  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2531  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3257  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000024832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5696  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2393  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26860  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2306  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 283 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.16135  normal  0.168565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04791  putative transcription regulator protein  32.71 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003833  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2275  regulatory protein LysR  31.97 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0922  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0788  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.232962  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>