More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3251 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  99.61 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  67.73 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  67.32 
 
 		 279 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  60.94 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  54.84 
 
 		 236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.19 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  46.4 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  46.94 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  48.02 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  49.8 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  45.34 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  42.91 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  46.75 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  44.31 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  42.04 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  45.74 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  40.39 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  40.56 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  38.08 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  42.06 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.87 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  41.37 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.76 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  45.53 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  37.7 
 
 		 346 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.69 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  37.4 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.71 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  36.51 
 
 		 235 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.33 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  36.33 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  33.2 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.93 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  34.82 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  34.39 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  35.25 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  30.74 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  38.68 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  36.07 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  31.09 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  30.89 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  35.74 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.51 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  34.02 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  34.27 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37.82 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.25 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  37.3 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.27 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  36.21 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  39.18 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  34.02 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  27.39 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  33.89 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  30.04 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  32.08 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  31.65 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  30.04 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  35.66 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  29.92 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  38.78 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  32.92 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.45 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  37.04 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  27.27 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  35.95 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  36.21 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  32.63 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  36.58 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  34.29 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  29.46 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  30.42 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  32.78 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  37.19 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  34.02 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  32.39 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  34.94 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  37.6 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  32.1 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  31.28 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  32.88 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  32.39 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  34.43 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>