More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4212 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  65.62 
 
 		 280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  65.62 
 
 		 270 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  62.6 
 
 		 286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  62.5 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  62.45 
 
 		 257 aa  308  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  60.48 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  63.95 
 
 		 283 aa  295  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  62.61 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  62.18 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  56.3 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  54.81 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  56.65 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  54.51 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  46.44 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  47.3 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  44.58 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  45.57 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.35 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.23 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  41.81 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.53 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.91 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  43.15 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.99 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.25 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.65 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.22 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  43.75 
 
 		 230 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  39.76 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.75 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  40.81 
 
 		 235 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.82 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  41.78 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.95 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  41.26 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  41.13 
 
 		 229 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.29 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  38.84 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.99 
 
 		 228 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  41.09 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.54 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.48 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 		 230 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.82 
 
 		 235 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.36 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.42 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  40.69 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.67 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  39.45 
 
 		 214 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  42.34 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.6 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  37.66 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  41.33 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  42.25 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  41.44 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  38.28 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  35.11 
 
 		 235 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  35.61 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.53 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  35.87 
 
 		 224 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  39.48 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  37.72 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.79 
 
 		 232 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  38.5 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  43.05 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.39 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.34 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.74 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  38.74 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  40.61 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>