More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2315 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  63.18 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  60.33 
 
 		 246 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  54.77 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  50.62 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.03 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  46.29 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  44.64 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  45.69 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.16 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  40.57 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  42.74 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  43.69 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  41.28 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  40.68 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  44.12 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  41.35 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  42.02 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  42.68 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  45.95 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  44.3 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 229 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  43.3 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.74 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.86 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.35 
 
 		 231 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.92 
 
 		 228 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.17 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 229 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  44.14 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  43.9 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.36 
 
 		 234 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.87 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  38.16 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  40.73 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.61 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.21 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  38.86 
 
 		 229 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.63 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  39.73 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.28 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.53 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  38.16 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  37.23 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.4 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  37.55 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  38.53 
 
 		 232 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  36.52 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.47 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.34 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  36.97 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.78 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.93 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  41.95 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  36.68 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 237 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.1 
 
 		 241 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  35.93 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.62 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  37.61 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>