More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0896 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  80 
 
 		 231 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  71.43 
 
 		 237 aa  338  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  69.13 
 
 		 230 aa  327  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  70.04 
 
 		 228 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  67.39 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  63.6 
 
 		 228 aa  291  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  60.79 
 
 		 228 aa  285  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  48.26 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  48.21 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  52.17 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  48.05 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  50.88 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  47.81 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  47.6 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  44.59 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  48.02 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  50.44 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  46.96 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.29 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.25 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  47.6 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  48.03 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  45.49 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  47.16 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  45.78 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  51.32 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  45.89 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  47.6 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  47.6 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  44.21 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  45.06 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  49.57 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  39.6 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  43.83 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  48.23 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  48.48 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  43.17 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  46.72 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  47.6 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  47.83 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  49.57 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  44.35 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  45.49 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  46.22 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.72 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  46.63 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  44.68 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  44.54 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  48.02 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.98 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  44.59 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.68 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  46.12 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  45.02 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  48.25 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  45.45 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  48.09 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  48.56 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  45.22 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  45.45 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  46.49 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  45.02 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  46.35 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  45.02 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  43.23 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  45.26 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  44.02 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  47.16 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  44.59 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  49.52 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  45.83 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  49.52 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  45.83 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  44.92 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  43.78 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  46.29 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  49.04 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  45.53 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>