More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1344 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  45.76 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  48.67 
 
 
224 aa  203  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  48.68 
 
 
235 aa  201  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  41.59 
 
 
228 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.94 
 
 
253 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.69 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.81 
 
 
231 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  43.05 
 
 
225 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.42 
 
 
237 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.68 
 
 
244 aa  191  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.5 
 
 
231 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  48.06 
 
 
219 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 
225 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 
229 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 
229 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  47.81 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  49 
 
 
202 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  38.29 
 
 
233 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  42.53 
 
 
234 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.48 
 
 
227 aa  175  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 
233 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  44.98 
 
 
275 aa  175  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.24 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  48.06 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.23 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 
235 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 
232 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 
234 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 
229 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.26 
 
 
231 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 
246 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  41.36 
 
 
228 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 
247 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 
235 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41.75 
 
 
223 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 
241 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.65 
 
 
219 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40 
 
 
226 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.4 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  39.74 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.85 
 
 
229 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  40.09 
 
 
242 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  40.89 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.53 
 
 
271 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  36.52 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  38.43 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.82 
 
 
229 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
241 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  41.06 
 
 
224 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.35 
 
 
213 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  36.96 
 
 
270 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 
231 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 
232 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  40.44 
 
 
227 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 
229 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  41.07 
 
 
220 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  37.07 
 
 
241 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.72 
 
 
271 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.64 
 
 
216 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  37.55 
 
 
236 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.23 
 
 
244 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  39.72 
 
 
223 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  36.56 
 
 
229 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.3 
 
 
228 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  36.96 
 
 
229 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.24 
 
 
229 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  35.74 
 
 
241 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  37.93 
 
 
236 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 
259 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  38.6 
 
 
241 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 
269 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 
237 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 
257 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 
243 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.24 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  37.72 
 
 
229 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 
231 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 
235 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  39.44 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  35.96 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.87 
 
 
222 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  37.39 
 
 
229 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  34.05 
 
 
239 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  34.21 
 
 
235 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 
237 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  35.84 
 
 
227 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  36.21 
 
 
237 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>