More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3912 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  51.1 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  50.98 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  49.58 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  50 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  48.73 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.61 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.52 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  45.22 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  50.99 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  52.94 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.47 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  48.67 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  47.84 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  48.23 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.29 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.93 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  48.36 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.06 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  40.09 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  40.71 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.49 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.38 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.47 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  46.72 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.14 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.96 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.67 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08910  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.96 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0151637  hitchhiker  0.0000000329342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.89 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.26 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  42.13 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  45 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.83 
 
 		 219 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  44.21 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.33 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.39 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.3 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.35 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.95 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.88 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.16 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  37.62 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  45.81 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  40.68 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.91 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.8 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  34.06 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.27 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  38.81 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  39.11 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  42.11 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  39 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  36.84 
 
 		 226 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  37.84 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  39.23 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.97 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.05 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.1 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  41.08 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  37.05 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  37.62 
 
 		 219 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.36 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  34.58 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  41.55 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.27 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  37.23 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  39.57 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  42.92 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>