More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1356 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  56.16 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  54.09 
 
 		 235 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.3 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  46.7 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.64 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  45.15 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.93 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  46.64 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44.88 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  38.84 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  42.5 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.27 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40.93 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  43.18 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  38.57 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  43 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.81 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.21 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.52 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 270 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  37.12 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  35.27 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  38.39 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.2 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  42.2 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.63 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  40.72 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.8 
 
 		 253 aa  164  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  39.73 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  40.27 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.59 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.32 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  42.5 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  37.95 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 		 269 aa  161  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  40.8 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  40.09 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  34.51 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  45.96 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  37.77 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  40.85 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.28 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  36.17 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.51 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  36 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.32 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.8 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.12 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  36.12 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  41.35 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  42.64 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  44.06 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  42.64 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.94 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  35.43 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  37.75 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.2 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  38.99 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  37.39 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  37.75 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>