More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2383 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  69.51 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  69.51 
 
 		 270 aa  345  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  68.57 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  69.08 
 
 		 286 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  64.94 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  70.16 
 
 		 283 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  64.68 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  62.45 
 
 		 269 aa  308  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  63.83 
 
 		 261 aa  307  9e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  63.14 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  60.76 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  61.02 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  59.83 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  47.48 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  48.12 
 
 		 246 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  48.13 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  42.15 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  44.54 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  48.5 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  47.35 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.23 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  41.59 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  45.45 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  47.22 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.49 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  45.69 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  43.1 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.1 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  42.61 
 
 		 230 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.06 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  44.87 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  40 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.49 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 219 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.81 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  41.44 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.56 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.39 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.99 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.59 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.89 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.74 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.93 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  38.84 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.84 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  43.36 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.07 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  42.67 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  38.97 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.04 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.95 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  34.36 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.92 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  40.71 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  37.99 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  37.99 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  43.69 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  37.99 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.99 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  37.99 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.05 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  45.92 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.92 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  45.92 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  42.6 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.6 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.05 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  43.67 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 		 232 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.81 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  42.39 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.98 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.54 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.92 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>