More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4225 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  48.91 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  43.95 
 
 		 275 aa  214  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  46.05 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  52.47 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  51.26 
 
 		 245 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  45.26 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  45.09 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  44.64 
 
 		 276 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1178  alanine racemase domain protein  47.52 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  normal  0.161066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  44.2 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.67 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  43.23 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  43.04 
 
 		 271 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  42.19 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  43.5 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  48.21 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  41.6 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.16 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.3 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.23 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.22 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  39.53 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.96 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.37 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  39.46 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  39.56 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.59 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  38.33 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  42.31 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.91 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.81 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.74 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.83 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.26 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.57 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.07 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  43.39 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.04 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  41.04 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  38.91 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  34.23 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  34.23 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  40.44 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.26 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  41.41 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.53 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.93 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.63 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  41.48 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  43.67 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.66 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  40.97 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.37 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.53 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  39.01 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  37.87 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  42.03 
 
 		 283 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  44.93 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.05 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.43 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 224 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  41.41 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  36.28 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  36.54 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3523  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.758278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  40.25 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  36.75 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.43 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  37.99 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.17 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>